怀孕六周腰疼可能是生理因素导致，也可能是病理因素导致，如先兆流产、盆腔炎、腰椎间盘突出。建议患者应立即前往医院产科或普内科进行B超等检查，明确病因，谨遵医嘱进行治疗。
一、生理因素：
怀孕期间由于孕激素的影响，可以导致关节韧带松弛，而且随着怀孕月份增加，子宫会增大，腰部会不自觉向后仰，导致局部肌肉拉扯，从而出现腰疼的现象。这是正常情况，一般不用特殊处理，不用过于担心，孕妇可减少活动，加强孕期营养。
二、病理因素：
1、先兆流产：由于怀孕6周胚胎还不稳定，若孕妇进行重体力活动或情绪波动太大，可能会刺激子宫，造成宫缩，形成先兆流产，可伴随腰疼。此时可以先观察，若疼痛加剧或伴有阴道出血，应立即前往医院就诊，可以遵医嘱使用地屈孕酮片、维生素E软胶囊等药物进行保胎；
2、盆腔炎：孕妇在怀孕期间可能不注意私处卫生，导致细菌进入阴道，逆行感染形成盆腔炎，导致盆腔部位充血、水肿，从而就会刺激腰部，出现腰疼的症状，并伴有腹痛等症状。若症状严重，可以遵医嘱使用苦参凝胶等药物进行缓解；
3、腰椎间盘突出：如果怀孕六周的孕妇腰椎间盘突出，突出的腰椎压迫局部神经，就可能导致孕妇 腰疼，可能伴有腿疼、活动不灵活等症状，此时可注意休息，也可适当进行热敷。
怀孕六周腰疼，建议孕妇注意休息，不要熬夜，避免情绪大幅度波动，也要适当进行体育锻炼，提高身体免疫力，并保持饮食清淡，营养均衡，忌食用辣椒等辛辣食物。