后腰两侧疼痛的原因包括腰肌劳损、腰背肌筋膜炎、腰椎间盘突出症等腰部疾病，以及尿路结石、肾炎等泌尿系统疾病，还有外伤等其他原因，建议患者及时就诊，从而明确诊断。
1、腰肌劳损：如果长期进行负重活动等，可以导致腰部肌肉及其附着点的筋膜、韧带或骨膜出现慢性损伤性炎症，从而出现腰疼等症状，疼痛部位可在后腰部两侧，还可放射到臀部。
2、腰背肌筋膜炎：腰背肌肉长期出现劳损或者久坐久站等都有可能导致腰背肌筋膜炎，由于受到炎症刺激，可造成腰背部肌肉疼痛，尤其是后腰两侧，疼痛可能会比较明显。
3、腰椎间盘突出症：可能是因为长期坐姿不良或者腰椎间盘退变等原因导致，腰椎间盘突出后，会对腰椎两侧的肌肉以及神经产生刺激，从而造成后腰两侧出现疼痛等症状，还可伴有坐骨神经痛以及下肢麻木等症状。
4、尿路结石：比如输尿管结石，如果结石比较大，导致输尿管梗阻，则会造成肾积水，而肾位于腰部两侧，患者可能会出现后腰两侧疼痛的情况，还可伴有肾绞痛等症状。
5、肾炎：一般是由细菌感染引起，是肾盂、肾间质和肾小管的炎症，患者可出现发热、腰部酸痛和肾区叩痛等情况，而部分患者可出现双侧后腰部疼痛等症状，伴有尿频、尿急等症状。
6、其他原因：如后腰部两侧同时受到外伤，或者存在泌尿系统肿瘤、盆腔炎等，受到肿瘤或者炎症刺激等，也有可能导致后腰两侧疼痛。
如果出现此类症状，由于患者一般无法自我判断原因，建议先到正规医院的骨科就诊，如果通过X线检查等确定此类情况不是骨科疾病导致，则需要到泌尿外科等科室就诊，进行尿常规等检查，从而明确诊断并且进行止痛治疗等。