显微镜观察主要是通过显微镜的目镜对物体进行观察，由于目镜较小，观察物体时背景光线较亮，长时间、近距离地使用显微镜，易对眼睛造成一定伤害，可以引发眼睛疲劳，影响视力，还可出现眼睛疼痛、干涩等不适症状。
1、眼睛疲劳：主要表现为睫状肌的痉挛，长时间的睫状肌痉挛还可导致晶状体变凸，使光线聚焦在眼底视网膜前，易诱发近视，对于已经近视的人，可能会引起近视度数的加剧；
2、眼睛疼痛：长期看显微镜会用到更多的眼睛调节，以帮助看清近处的物体，如果本身是年龄较大的人群，已经存在有视近困难，即老花眼的情况下，长时间看显微镜会使眼睛的疲劳进一步加重，易引发眼睛疼痛，严重情况下还可出现恶心、呕吐等症状；
3、眼睛干涩：长期看显微镜，会由于注意力比较集中而使眨眼次数减少，眨眼可起到泪膜更替的作用，眨眼次数减少，可导致眼表组织得不到良好的滋润、营养，容易发生眼睛干涩、酸胀等不适症状，甚至引发干眼症。
如果因工作或学习需求，需要长期看显微镜，无法减少用眼时间，为减少长时间用眼带来的损害，建议在长时间、近距离用眼后，利用休息时间多眺 望远处，也可做一些眼部的保健操以放松眼部肌肉，舒缓肌肉紧张的状态，缓解眼部不适。