真菌感染老是反复发作的情况，主要与机体免疫功能低下、真菌致病力较强密切相关。真菌有较强的侵袭力，一旦侵入组织内不容易自愈。
1、机体免疫功能低下：真菌感染好发于严重的基础疾病及免疫功能低下患者，例如应用细胞毒性免疫抑制剂，长期大量使用广谱抗生素及长期导管留置等患者，或者患者有糖尿病、恶性肿瘤等严重的基础疾病。由于此类患者免疫缺陷，无法清除致病真菌，会使得真菌感染迁延不愈；
2、真菌致病力较强：真菌具有较强的侵袭性，可以在组织内不断扩散。真菌可以产生水解酶、磷脂酶、蛋白酶等多种酶，促进病原菌黏附、侵袭，造成细胞变性坏死，导致组织器官损伤。真菌还可以激发抗原抗体反应，激活补体系统，导致大量炎细胞浸润，产生免疫反应，真菌感染总是会反复发作。
治疗真菌感染应该及时去除各种诱发因素，积极治疗原发病，加强机体营养，使用免疫调节剂，增强机体免疫功能，积极治疗粒细胞缺乏症、各种恶性肿瘤。机体免疫功能改善后，真菌感染才能够彻底治愈。