16岁手淫的危害通常和手淫频率有关，偶尔手淫是一种正常排精的途径，通常对身体没有危害，而长期频繁手淫可能影响生长发育，增加尿路感染、前列腺炎的发生几率，还可能引起性功能障碍等。
一、偶尔手淫：
如果16岁偶尔手淫，如1个月手淫1-2次，符合正常的生理需求，也是一种排精途径，通常对身体没有明显危害，注意局部卫生即可。
二、长期频繁手淫：
1、生长发育：16岁正处于生长发育阶段，长期频繁手淫可加重生殖器官的负担，也会导致体内营养物质流失。手淫后还可能导致精神不集中、焦虑等，这些因素可进一步影响体内激素的分泌，从而影响身体的生长发育，尽早彻底戒掉手淫能逐渐恢复；
2、尿路感染：16岁手淫时如果没有注意尿道口的卫生，细菌容易通过尿道口逆行进入到膀胱。长期频繁手淫容易引起尿路感染，表现为尿频、尿急、尿痛，还可引起小腹疼痛。男性出现尿路感染后，需要在医生指导下使用头孢呋辛酯片、左氧氟沙星片等药物控制感染，同时要多喝水，勤排尿；
3、前列腺炎：手淫时前列腺腺管处于开放状态，细菌也容易逆行进入到前列腺，16岁长期频繁手淫可增加前列腺炎的发生几率，表现为会阴部疼痛、尿急、尿痛等症状。男性出现前列腺炎后需要在医生指导下使用前列舒通胶囊、头孢地尼胶囊、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物治疗，同时要避免久坐，忌食辛辣、刺激性食物；
4、性功能障碍：16岁长期频繁手淫，可能会导致龟头敏感性减弱，还可影响体内激素的分泌，造成性欲减退、勃起硬度减弱，严重者可能会影响到成年后正常同房，手淫引起的前列腺炎如果长期没有治愈，也容易继发性功能减退的情况。
16岁的年纪较小，要尽量戒掉长期频繁手淫的习惯，并且保持规律的生活作息习惯，不熬夜，适当锻炼，有利于身体健康，平时也要多喝水，勤排尿。如果偶尔手淫后出现小便不适症状，需要及时就诊，根据具体情况选择用药治疗。