栓子和血栓都可以造成血管的堵塞，造成靶器官的缺血。但是两者属于不同的概念，其区别主要包括，来源不同、发病原因不同、可能堵塞部位不同。
1、来源不同：栓子一般指某个部位形成的血栓掉落导致其他部位的栓塞，如心脏内血栓掉落导致脑动脉栓塞、内脏动脉栓塞或下肢动脉栓塞，下肢深静脉血栓掉落导致肺动脉栓塞等。而血栓则是指由于血管损伤、血管硬化斑块破裂、高凝状态或血流瘀滞等因素所致的原位血液凝固，堵塞病变部位的血管；
2、发病原因不同：常见的栓子来自心脏，发病原因一般是未控制的心房颤动。常见的血栓一般包括下肢深静脉血栓、下肢动脉血栓形成，前者主要是血管损伤、高凝状态和血流瘀滞所致，后者则一般是动脉粥样硬化斑块破裂导致血小板在破裂处聚积所致；
3、可能堵塞部位不同：栓子属于异位堵塞，如心房血栓掉落可能堵塞全身各处的动脉，导致靶器官缺血。血栓则一般是原位堵塞，导致血管不通畅。
但栓子和血栓两者也有联系，血栓可继发于栓塞的基础上发生。两者都会导致靶器官缺血，一般会造成明显的临床症状，属于临床的危急重症，需要及时进行治疗。