新生儿进行染色体检查时，由于检查项目、就诊医院等的不同，所需花费的费用也有所不同，如染色体核型分析价格在500-600元左右，而染色体微阵列分析的价格约在4000-5000元左右，建议提前咨询权威医疗机构。
染色体异常的形式有很多，如数目异常，常见的有21号染色体异常，又叫21-三体综合征、先天愚型。还有染色体片段缺失、重复等异常情况，新生儿往往会有特殊面容，比如耳位低、眼睛间距宽、小头畸形、腭裂、脏器发育畸形、生长发育差等情况。如果考虑染色体有问题的话，建议在医生指导下完善相关检查。建议选择权威医院开展检查，以保证检查、诊断的准确性，以免出现误诊、漏诊等情况。不可过于追求价位的高低，应当在医生建议下选择恰当的检查方式。
除新生儿染色体检查外，孕期也会进行唐氏筛查等染色体检查，可判断胎儿是否存在常见染色体发育异常的风险，如13号、18号及21号染色体有无数目异常，可根据检查结果评估风险等级，一般分为低风险、中风险、高风险3级。根据检查结果医生会建议是否需要进一步完善其他项目的检查，比如羊水穿刺检查等，以及时发现胎儿的异常情况，避免影响胎儿的正常生长发育。该检查的费用也与就诊医院的不同等因素有关，但相较于新生儿染色体检查，所需费用相对较少，通常在数百元内。