男性高危56型阳性通常指男性高危型HPV56型阳性，如果男性感染56型HPV病毒后未发病，多数可以自愈，并不一定需要治疗，但也有少部分变为亚临床感染，此种情况下需要进行治疗。
1、感染后未发病：大多数人一生中都会经历HPV感染，不管是感染高危型HPV，还是低危型HPV，机体产生的免疫机制都可清除HPV，男性高危型HPV56型阳性，此时可能未发病，绝大多数男性高危型HPV56型阳性呈一过性，且无临床症状。临床上大多数高危型HPV56型阳性的感染者，在2年内可以自愈，不需要进行特殊治疗。平时可以积极锻炼身体、适当增加饮食营养，身体免疫力提高后，更有利于促进男性高危型HPV56型阳性自愈；
2、亚临床感染：男性高危型HPV56型阳性后，可能没有表现出任何临床症状，仅表现为HPV56型持续阳性，此时具有一定的传染性，可通过性接触等方式传染给女性性伴侣，增加女性宫颈癌的发生几率，所以高危型HPV56阳性的男性，在性生活中注意全程佩戴避孕套，尽量避免感染女性。另外，具有传染性而且持续长时间存在的男性高危型HPV56型阳性患者，可以遵医嘱应用药物治疗，如阿昔洛韦、伐昔洛韦等，还可遵医嘱应用转移因子或胸腺肽等药物进行系统治疗。
如果男性高危型HPV56型阳性，经检测结果一直呈阳性则可进行治疗，治疗时应注意性伴侣的同检、同治，以免交叉感染。