小三阳通常指的是乙肝小三阳，患者可以考虑遵医嘱注射干扰素，或口服核苷类的抗病毒药治疗，对于控制乙肝病毒的复制有作用。但需注意的是，乙肝小三阳是否需要治疗，应查肝功能、乙肝病毒定量和肝脏彩超等，来综合判断。如果患者肝功能正常，HBV-DNA在正常范围内，彩超正常，则小三阳患者暂时不需要特殊治疗，每半年定期体检即可。
如果小三阳患者HBV-DNA明显增高，并且肝功能、生化转氨酶的检查异常，说明患者处于乙肝活动期，这时可以遵医嘱注射干扰素进行治疗，如使用注射用重组人干扰素α2a，可使乙肝病毒的复制得到控制，从而使HBV-DNA转阴，但以上治疗难以彻底清除乙肝病毒。
经过治疗的乙肝小三阳患者，部分人可能会出现表面抗原转阴，此时还应每隔三个月或半年左右定期复查肝功能、HBV-DNA、腹部彩超、甲胎蛋白、肾功能、血糖、血脂、血常规的情况。如果HBV-DNA超载合并肝功能不正常，比如转氨酶或胆红素的升高或有早期纤维化，可以遵医嘱选择恩替卡韦片、富马酸丙酚替诺福韦片等药物进行治疗。
乙肝小三阳患者平时要注意不要熬夜、劳累，一定不要喝酒，避免随便乱服药物。可以适当多吃新鲜蔬菜 和水果、高蛋白食物，少吃腌制品、辛辣刺激性食物。