小孩疱疹导致发烧39度，要持续几天不能一概而论。部分小孩体质较好，可能1天左右便能够退烧。而另一部分小孩体质较弱，可能发烧会持续5天以上。另外，疱疹具有传染性，在治疗期间还需要积极进行隔离。
小孩患上疱疹，主要由于体质较差，受到疱疹病毒感染，而在感染之后，小孩身体各项机能会逐渐降低。此时白细胞出现升高的表现，便会导致身体发烧，需要及时进行退热治疗。发烧39度属于高烧，还需要服用退烧药物，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。并且注意在发烧时不建议盲目用药，需要针对疾病进行抗病毒治疗，如阿昔洛韦等，同时进行退烧治疗。服用退烧药后大量出汗还容易导致身体脱水，需要积极补水，并且要适当休息、避免剧烈运动。出现瘙痒症状时需要避免搔抓。需要注意避免在发病期洗澡，以及使用过烫的热水，否则容易刺激皮肤，导致不适症状加重。