HER2阳性乳腺癌二期通常是指HER-2阳性乳腺癌Ⅱ期，如果及时进行治疗，患者10年生存率可以达到近80%，但若没有及时进行治疗，生存率就会降低，具体生存率尚不明确。
HER-2阳性乳腺癌更具有侵袭性，而且肿瘤生长速度较快，可能会在早期通过淋巴或者血行等途径出现远处转移，预后较差。如果HER-2阳性乳腺癌Ⅱ期的患者及时进行靶向治疗或手术切除治疗，患者治疗效果及预后得以显著提高，10年生存率可高达近80%，晚期HER-2阳性乳腺癌的生存期也显著延长，一半以上的患者生存期接近5年。但如果治疗不及时，随着病情进一步发展，出现浸润或转移，其生存率就会降低，具体的生存期因人而异，没有准确的范围。
分子靶向药物可与HER-2的特定部位结合，阻断肿瘤细胞的信号传导，适用于HER-2阳性乳腺癌患者的治疗，常用药物包括注射用曲妥珠单抗、帕妥珠单抗注射液等，还能够降低乳腺癌患者术后的复发转移风险，提高患者的生存率。