矮小症若能早期发现、正规治疗，绝大多数患者的身高可得到较好改善，导致矮小症的原因较多，常见的有特发性矮小、家族性矮小、体质性青春发育期延迟、生长激素缺乏、软骨发育不全、甲状腺功能减退等。针对矮小症的患者，积极对因治疗是关键。除甲状腺功能减退导致患者出现矮小症外，其他原因导致的矮小症通常可以使用生长激素替代治疗，但具体治疗效果因人而异。
1、病因治疗：日常生活中需保证营养均衡，并保证充足的睡眠，以及适当增加运动量。若早期发现矮小症患者存在甲状腺功能减退，需积极补充左甲状腺素钠片改善甲状腺功能，甲状腺功能恢复改善后身体发育也会逐渐改善；
2、生长激素替代治疗：针对特发性矮身材、家族性矮小、体质性青春发育期延迟、软骨发育不全、生长激素缺乏者可采取外源性注射生长激素的方式促进身高的发育，但生长激素的应用有严格适应证及使用时间，较佳的应用时间是青春期之前，如骨垢线已经大部分或完全闭合，再使用生长激素替代治疗效果通常不明显。
因此，大多发现早且症状较轻的矮小症一般能治好，但对于程度较严重且治疗较晚者，治好的可能会降低。