正确使用碘甘油后不需要漱口，碘甘油是外用药，主要用于治疗口腔黏膜溃疡、牙龈炎、牙周炎及冠周炎等疾病。治疗时需将病损周围擦干净，而后用棉签蘸少量的碘甘油涂于患处，通过上述方法用药的时候，口中并无过多的碘甘油药物，且药物使用后需过一段时间才可吸收，因此不需要刚上完药就漱口。
如果觉得嘴里有碘甘油存积，出现嘴里发涩或不舒服等症状，可以在用药后0.5小时再漱口。如果上药后口腔中碘甘油过多，也可以马上漱口，以免发生吞咽。碘甘油属于消毒防腐剂，作用机制是使菌体蛋白质变性、死亡，对细菌、真菌、病毒都有一定的杀灭作用，且副作用较小，常见的不良反应是碘过敏，即出现局部红肿热痛等发炎症状，甚至会出现皮疹。
建议使用碘甘油治疗期间，注意饮食控制，即清淡饮食，避免辛辣、刺激性食物，以免刺激局部创面或炎症，出现症状加重的现象。此外，建议增加维生素类食物的摄入，如新鲜的蔬菜和水果，包括柚子、橘子、苹果、菠菜等，以促进症状的缓解。