眼睛长黄色的小颗粒可能是睑板腺囊肿、结膜结石、眼部单纯疱疹、粟丘疹导致。若患者出现了眼部疼痛等不适，建议前往医院眼科进行检查，并遵医嘱根据病因进行治疗。
1、睑板腺囊肿：通常是由于患者长期食用油腻、辛辣等食物，导致体内油脂分泌过多，睑板腺分泌物增多，使睑板腺阻塞发生堵塞，由于分泌物无法排出，形成睑板腺囊肿，会出现眼睛长黄色的小颗粒，并伴有充血、发红等症状。患者可遵医嘱使用氧氟沙星滴眼液、普拉洛芬滴眼液等药物进行治疗，也可手术切开引流；
2、结膜结石：如果患者长期处于风沙环境，或者使用脏手揉搓眼部，导致细菌滋生，引起结膜炎，炎性分泌物可与沙石等物质凝聚、堆积，形成结膜结石，造成眼睛长黄色的小颗粒的现象，并伴有眼部疼痛、畏光、流泪等症状。一般可通过结石剔除术进行治疗；
3、眼部单纯疱疹：由于患者不良的生活习惯和饮食习惯，导致身体抵抗力下降，加上患者眼部受到损伤，使单纯疱疹病毒通过损伤处侵入眼部，引发眼部单纯疱疹，在炎症的刺激下出现眼睛长黄色的小颗粒，并伴有眼睛红肿、酸胀疼痛等症状。患者可遵医嘱使用更昔洛韦眼用凝胶、阿昔洛韦片等药物进行治疗；
4、粟丘疹：为表皮或附属器上皮的潴留性囊肿，原发性粟丘疹并无明确原因，继发性粟丘疹多见于既往有外伤或疾病等情况，原发者好发于颜面，特别是眼睑周围，典型皮损为黄白色、坚实性丘疹，可造成眼睛长黄色的小颗粒的情况。皮损表面光滑，可挤压出坚实的角质样球。一般患者无自觉症状，皮损发展缓慢，可持续多年，偶可自然脱落消失。有医生操作将局部消毒后用针挑破表皮，剔出黄白色小颗粒，另外激光消融和电干燥法也可以作为治疗选择。