临床中吗啡制剂一般不用于治疗呼吸疾病、内分泌疾病、脑部疾病等，且患者需要在医生指导下使用吗啡制剂，避免擅自用药而出现不适症状。
1、呼吸疾病：常见有支气管哮喘、肺气肿、肺源性心脏病等呼吸疾病，以支气管哮喘为例，通常是患者呼吸道内发生炎症而引起气管痉挛，患者可出现喘息、气促、胸闷、咳嗽等症状。而吗啡制剂除了具有镇痛、镇静的效果，还有镇咳、抑制呼吸等作用，呼吸疾病患者使用吗啡制剂时容易抑制呼吸中枢，促使支气管收缩而加重疾病；
2、内分泌疾病：常见有甲状腺功能减退症、糖尿病等疾病，以甲状腺功能减退症为例，患者体内的代谢速度缓慢，对药物耐受力降低，疾病未控制就使用吗啡制剂，可能会诱发水肿、昏迷等症状，加重甲状腺功能减退症；
3、脑部疾病：常见有脑出血、脑梗死等疾病，以脑出血为例，疾病发生时大脑组织逐渐增大，可引起脑水肿，进而引起颅内压增高，此时使用吗啡制剂容易促使脑部血管扩张，增高颅内压而加重出血现象。