染色体倒位是一种染色体结构的异常，是指染色体出现两个断裂点，两个断裂点间的染色体片段旋转180度后，与断裂点外侧染色体片段重新连接形成新的染色体。
染色体倒位又分为臂内倒位和臂间倒位，臂内倒位是指染色体倒位的区域发生在染色体的同一臂上，臂间倒位是指染色体的长臂和短臂各发生一次断裂，断片倒转180度后重接。倒位虽然没有改变染色体上的基因数量，但改变了基因的顺序和相邻基因的位置，因此在表型上产生了遗传变异，主要病理特征为生长发育迟缓、智力低下、语言障碍、动作行为异常、肌张力减退、斜视、皮纹异常等。不同部位的染色体倒位，出现的结局有所不同，可以通过染色体检查的方式了解有无倒位的情况发生，然后通过数据库内相同倒位出现的表型异常，进行遗传咨询。
如果染色体倒位是来源于父母双方的遗传，且父母双方没有明显的表型异常，通常认为胎儿大多也不会出现表型异常的情况。但如果为新发突变，且数据库中有类似异常等病例出现，则胎儿出现异常的风险会增高，可考虑引产终止妊娠。