临床上婴儿可能会由于感染等因素导致痰液黏稠，使得痰液不容易咳出。进行药物治疗后如果效果不佳，再加上婴儿的器官功能发育不成熟，排痰能力比较差，因此可能会遵医嘱进行吸痰治疗。婴儿吸痰的危害主要是可能会引起呼吸道黏膜损伤、气道反应，以及咽反射等。
1、呼吸道黏膜损伤：由于婴儿的呼吸道黏膜相对成人稚嫩，由于吸痰时所使用的吸痰管属于异物，入侵婴儿的呼吸道时，有可能会导致婴儿的上气道，包括鼻腔、咽喉部黏膜出现损伤，有时甚至会出现少量出血的情况；
2、气道反应：当吸痰管入侵婴儿呼吸道时，还有可能因异物入侵导致婴儿出现气道反应，使得婴儿咳嗽暂时性加剧，但停止吸痰后，婴儿的此类症状通常可以缓解；
3、咽反射：吸痰时如果刺激婴儿的咽后壁，可能会导致婴儿出现恶心、呕吐等咽反射症状。如果未及时发现婴儿呕吐，也未及时将呕吐物清出口腔，还有可能导致婴儿呛咳，甚至有使婴儿窒息的风险；
4、其它：如果在给婴儿吸痰的过程中操作不当或操作不熟练，可能会使得吸痰时间过长或吸痰不彻底，使得婴儿出现成窒息或痰堵，容易引起继发感染。
婴儿吸痰的危害一般为暂时性危害，婴儿吸痰利大于弊，吸痰能够将痰液排出，清理婴儿的呼吸道，以保持呼吸道通畅，预防吸入性肺炎、窒息、肺不张等情况出现，有利于解除婴儿呼吸困难等症状，可以促进疾病恢复。吸痰时要注意调小压力，动作轻柔、准确，每次吸痰时间不要过长，不建议在婴儿进食后进行吸痰治疗，以免引起恶心、呕吐等不良反应。在吸痰过程中和吸痰后都要注意时刻关注婴儿的呼吸变化，痰多时要给婴儿多喝水，以促进痰液排出。