龟头上小红点是否会自愈，需要根据引起小红点的具体原因进行判断。若为性生活或手淫等过度刺激所致，一般会自愈，但若为龟头炎、珍珠状阴茎丘疹等疾病引起，通常不会自愈。
1、过度刺激：若患者由于性生活、手淫等因素刺激，引起阴茎部位毛细血管扩张，龟头上出现出血点，通常无其他不适症状。一般待刺激因素消除，龟头上的小红点也会随之消失，因此会自愈，建议日常避免手淫等不良习惯。
2、龟头炎：主要由于细菌、病毒、过敏等因素刺激龟头部位黏膜，引起局部组织充血、水肿所致，还会伴随瘙痒、疼痛甚至水疱等症状。此时需要遵医嘱使用克霉唑乳膏、红霉素软膏等药物，才可以使疾病达到治愈的目的，而不会自愈。
3、珍珠状阴茎丘疹：多由于包皮过长、手淫等因素长期刺激龟头局部黏膜所致，表现为沉着龟头冠状沟有序排列的丘疹，无其他不适症状。一般不用进行特殊治疗，但若继发感染，出现红肿、疼痛的情况，需要遵医嘱使用莫匹罗星软膏等药物，无法自愈。
因此，若出现龟头上小红点的症状时，可以到医院男科、皮肤科就诊，根据患者具体情况明确原因，并给予相应治疗，切记避免自行涂抹药物，以免导致病情加重。