吃药了后发现怀孕了，有可能会影响胎儿的发育，但应具体情况具体分析。一般孕妇妊娠12周内，即前3个月是胎儿发育的关键时刻，在此阶段的用药需谨慎。如果用药不谨慎，容易导致胎儿发育不良，甚至致畸。
如果孕妇出现躯体不适，如头痛、乏力等，应及时就诊妇产科，在医生指导下用药。如果是在怀孕之前吃的药，由于药物有代谢周期，以及半衰期短，可能吃药后再怀孕，通常不会对产妇造成影响。但如果在怀孕后吃药，或者部分药物的半衰期比较长，可能会影响胎儿发育，所以应该积极就诊，并让医生给予指导。如果决定保留胎儿，一定要定期体检，尤其是产前超声筛查，同时建议孕期放松心情，不要过于紧张。
如果是头孢、青霉素等药物，例如头孢呋辛酯等，以及临床中常见的肝素等抗凝药物，对胎儿的影响相对较小，在孕早期，即12周内可酌情使用，但部分药物，比如左氧氟沙星等，可能会影响胎儿发育。一般孕20周后，用药对胎儿发育的影响会减小，不如怀孕前3个月敏感。一旦吃药以后发现怀孕，要去妇产科就诊，让医生评估所用药物对胎儿的影响，并及时进行相应处理。