存在毛囊炎是否可以打新冠疫苗需根据具体情况判断。若为毛囊炎急性期，出现全身性症状，则不建议打新冠疫苗，因为此时属于感染急性期，打完新冠疫苗可能会出现不良反应，如发烧、头晕等，加重毛囊炎或影响新冠疫苗效果。若在毛囊炎非急性期，则可以打新冠疫苗，二者互相间不会有什么影响。打新冠疫苗后可激活身体免疫系统，产生新冠病毒的抗体，而降低新冠病毒的感染风险。
存在毛囊炎，应先联系接种点明确能否打新冠疫苗，若为急性期可能需要优先治疗，遵医嘱口服抗炎药物，如头孢类、大环内酯类等以及局部外用莫匹罗星软膏等；也可采用物理治疗如激光等；必要时也可能需要手术治疗，如切除病灶，将脓液引出。当疾病治愈后再联系接种点打新冠疫苗。如果是接种新冠疫苗第一针后出现急性毛囊炎，此时应立即联系打新冠疫苗的社区或单位工作人员说明自身情况，明确是否可以打新冠疫苗，若不能打新冠疫苗，需咨询延期接种或补种。
毛囊炎患者在日常生活中应注意个人卫生，保持皮肤干燥、清洁以及避免使用油性或刺激性护肤品，以免堵塞毛孔，滋生细菌，造成再次感染。此外，除存在急性毛囊炎不可以打新冠疫苗外， 有其他急性炎症、神经系统疾病，以及对疫苗过敏的人群也不建议打新冠疫苗。若无法明确自身情况能否打疫苗，需及时咨询接种点或医生。