药流后第十三天有少量深色血伴有腰疼，属于异常症状，可能与过于劳累、药流不全、子宫收缩不良等因素有关。但不论与哪种原因有关，如果持续出血，未见明显好转，则建议患者尽快就诊于妇科，针对病因尽快处理。
1、过于劳累：药物流产会损伤身体气血，术后还没有充分休息，急于从事重体力劳动，则会导致未完全修复的子宫内膜出血，并伴有腰酸等不适症状。建议患者在药流后充分休息，食用蛋白质、维生素较多的食物，如豆制品、蛋类、禽类等，促进身体尽快恢复；
2、药流不全：对药物敏感性不佳、肥胖、前列腺素不足的女性容易发生药流不全，建议药流后有少量阴道出血伴有腰痛的患者，遵医嘱进行B超检查，若提示宫腔内的残留<2cm，可遵医嘱应用益母草颗粒促进宫腔内残留排出；但如果残留＞2cm，或保守治疗1周后效果不佳，则建议行清宫手术；
3、子宫收缩不良：妊娠时间较长的女性，由于孕囊组织发育良好，因此药流中会加重对子宫内膜的伤害，导致子宫内膜的修复速度变慢，导致药流后出现少量阴道流血、腰痛等不适症状。建议及时就医，通过遵医嘱使用缩宫素注射液以促进子宫收缩 ；出血严重者还可应用刮宫术止血；
另外，宫内感染也会导致类似症状出现，可遵医嘱用药进行抗感染治疗。米非司酮片不但会起到促使孕囊排出体外的作用，还会引起抗凝纤溶系统变化，也可引起药流后出血、腰痛等不适症状。