儿童肠易激综合征(IBS)是儿童慢性肠道功能紊乱性疾病中常见的疾病，目前儿童肠易激综合征虽然病因不清，发病机制复杂，可能与遗传因素、精神因素、药物因素、不良生活习惯、肠道菌群失衡等原因有关。
1、遗传因素：儿童肠易激综合征的发病具有家族倾向，直系亲属患有肠易激综合征，比如父母患有肠易激综合征，其子女出现肠易激综合征的相对危险度与其他人群相比明显增高。
2、精神因素：儿童肠易激综合征患病率与性格特征有关，儿童肠易激综合征的儿童容易情绪激动、不安、焦虑和抑郁，家长需要注意观察儿童的情绪，多陪伴关心儿童，让儿童保持乐观心情。
3、药物因素：如果长期用药，比如长期盲目使用抗生素，非甾体抗炎药，容易出现儿童肠易激综合征，家长应避免盲目给儿童用药。
4、不良生活习惯：长期喝浓茶、咖啡或者是吸烟，或者是长期高纤维素因素，容易出现儿童肠易激综合征。日常儿童应避免长期喝浓茶、咖啡，家长应避免吸烟，避免让儿童被动吸二手烟。
5、肠道菌群失衡：儿童肠易激综合征的儿童存在双歧杆菌和乳杆菌数量减少，大肠埃希菌、类杆菌和肠杆菌等数量增加，导致肠道菌群失调。肠道微生态失衡，引起肠道细菌介导肠黏膜炎症，导致肠道黏膜屏障损伤、肠道黏膜免疫机制紊乱、肠道代谢紊乱与肠道内在敏感性增加，促进儿童肠易激综合征的发生和发展。此时，可以听从医生建议使用双歧杆菌三联活菌肠溶胶囊、双歧杆菌乳杆菌三联活菌片等药物调理。
除上述原因外，如果存在肠道感染、寄生虫感染，或者是发生脑-肠轴失衡等，容易出现儿童肠易激综合征，建议积极前往小儿消化科就诊治疗。