肌酸激酶同工酶是反映心肌损伤、坏死的特异性标志物，可能是生理性升高，也可能是病理性升高，由心肌炎、急性心肌梗死等引起，若要使升高的肌酸激酶同工酶快速下降，则需要积极治疗原发病。
一、生理性升高：
如果是由于患者本身在服用他汀类药物，如洛伐他汀、普伐他汀钠片等，或者在检查前剧烈运动，如长跑、骑行等，都会导致检测结果出现肌酸激酶同工酶偏高的情况，建议在停药后或者充分休息后再次检查，一般该指标可恢复正常，无需进行处理。
二、病理性升高：
1、心肌炎：包括病毒性心肌炎、细菌感染引起的心肌炎，以及肿瘤放化疗引起心肌损伤导致的心肌炎等，如果想要肌酸激酶同工酶降下来，应终止对心肌的损伤。病毒性心肌炎要进行抗病毒治疗，可以使用利巴韦林、更昔洛韦等药物。若出现严重的细菌感染可以使用头孢类或者喹诺酮类抗生素，如头孢曲松钠、莫西沙星等积极控制感染。如果是由于放疗、化疗后引起的心肌继发性损伤，应尽快停止放疗、化疗，同时进行营养心肌的治疗，如给予磷酸肌酸钠及维生素C，经过对症治疗后肌酸激酶同工酶也会快速降下来；
2、急性心肌梗死：如果狭窄或闭塞的血管造成心肌缺血、坏死，需要尽快开通闭塞的血管，从而使肌酸激酶同工酶降低。对于ST段抬高的心肌梗死，需要在6小时内使用尿激酶、链激酶等进行溶栓，闭塞血管开通后，心肌能够恢复血液供应，肌酸激酶同工酶等相关的心肌酶学标志物就不会升高，可出现快速下降。另外还可以通过微创介入的方式，用球囊或者抽气导管将闭塞的血管打通，抽取血栓，必要时可以安置支架，血管再通后肌酸激酶同工酶也可以降低。
除了上述因素，急性骨骼肌坏死、恶性肿瘤等，都可能会导致肌酸激酶同工酶数值异常，通常在医生指导下积极进行原发病治疗，肌酸激酶同工酶测量前一天应注意清淡饮食，禁忌吸烟饮酒，在医生指导下暂停使用影响肌酸激酶同工酶数值的药物，并且保证充足休息，检查前注意空腹，以免影响检测数值准确性。