催眠治疗的后遗症主要有一般反应、记忆力减退、情绪暴躁，以及人格改变等。由于催眠的后遗症很多，建议不要经常使用催眠的方式入睡，如果出现入睡困难的情况，建议立即去医院的神经内科就诊，在医生的指导下明确病因，积极治疗，避免加重病情。
1、一般反应：大多数人在催眠后会出现头昏、头疼、无力、多梦等不适症状，出现这些反应的原因可能与经过长时间的催眠有关，也有可能是在深催眠状态下强制性地叫醒被催眠者所致；
2、记忆力减退：催眠有助于增强记忆能力，但在催眠状态下运用不当的暗示后可损及受术者的记忆，甚至对以前的记忆也有影响。一旦出现这种情况，需要在下一次催眠中进行加强记忆的训练；
3、情绪暴躁：由于催眠时对被催眠者的暗示不正确，或对于被催眠者心理矛盾的症状表达出来后，没有给予正确的诱导和分析，所以会使被催眠者醒来后出现情绪急躁或抑郁等现象；
4、人格改变：人在催眠状态时，大脑皮层会得到休息，如果在催眠的过程中暗示不当，会导致被催眠者的人格受到施术者的影响，从而导致被催眠者人格改变。