腺样体肥大手术主要具有可以改善通气功能的利端，弊端都可能会引起感染、出血、咽鼓管受损等不良反应。但是腺样体肥大手术总体的治疗效果较好，出现手术后不良反应的概率很小，一般无需过于担心。
1、利端：腺样体肥大患者，可能会因为肥大的腺样体堵塞呼吸道，进而出现鼻塞、睡眠打鼾、张口呼吸等不适症状，如果不及时处理还可导致出现腺样体面容。而腺样体肥大手术可以通过腺样体刮除术、鼻内镜下腺样体切除术、低温等离子消融术等方法来切除腺样体组织，改善鼻孔堵塞的情况，同时改善通气功能等一系列不良反应；
2、弊端：手术属于有创操作，在手术过程中如果未做到无菌原则，可能有感染风险，但极少出现。在手术后的恢复过程中护理不当，也有一定被感染的风险。腺样体肥大手术可引起出血的情况，具体可以分为原发性出血和继发性出血，原发性出血是在手术过程中切到血管，或操作时使血管破裂，但腺样体周围无大血管，出现可能性小。继发性出血多是感染所致，除采取止血措施外，还需要使用抗生素药物治疗。另外，咽鼓管近鼻咽部通道离腺样体很近，在手术过程中容易损伤到 咽鼓管通道，形成瘢痕会使咽鼓管狭窄或关闭，继而出现听力下降、耳鸣、鼓室积液等症状，严重时可导致化脓性中耳炎。