扇贝里面黄黄的东西可能是扇贝的生殖腺，也可能是扇贝的腮。雌性扇贝的生殖腺在非繁殖季节没有颜色，呈半透明状态，但到了繁殖季节生殖腺颜色会逐渐变深，后期可能变成橘红色、橘黄色，雄性扇贝的生殖腺通常为乳白色。另外，扇贝的腮也可以呈黄色，但形状与睫毛类似，比较容易同扇贝的生殖腺区别开来。
扇贝的生殖腺可以食用，并且味道鲜美，含有丰富的营养物质，如镁、钾、蛋白质等，热量也不高。但是扇贝的腮不可以食用，因为腮其实就是扇贝的呼吸器官，可能存在泥沙等废物。另外，扇贝中的砂囊也不能食用，砂囊即扇贝的消化腺，里面含有较多废物，在扇贝中为黑色的物质。
肠胃不好、体质虚弱的人群建议少吃或不吃扇贝，避免加重胃肠道负担。另外还要避免食用半熟或者未熟的扇贝，因为这些扇贝中可能存在寄生虫、病原菌，容易引起感染性疾病。