阴囊根部长了很多小疙瘩，可能是由于珍珠状阴茎丘疹、毛囊炎、阴囊湿疹、生殖器疣、皮脂腺囊肿导致。建议患者及时到正规医院的皮肤科等科室就诊，进行视诊等明确诊断，并在专业医生的指导下进行针对性治疗。
1、珍珠状阴茎丘疹：可能是由于包皮过长、局部卫生较差、包皮冠状沟感染等导致，患者的阴茎、阴囊等部位会出现珍珠状、半透明的丘疹。若无症状患者可无需特殊处理，若伴有不适可遵医嘱使用莫匹罗星软膏等药物治疗，以及通过冷冻、电灼等方式治疗。
2、毛囊炎：主要是细菌、真菌感染毛囊导致，局部会出现化脓性炎症，表现为红色毛囊性丘疹，伴有红、肿、热、痛的炎症反应，严重时可出现化脓、破溃、坏死。建议患者遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物治疗。
3、阴囊湿疹：可能与过敏体质、精神因素、新陈代谢障碍等有关，会导致局部出现红斑、丘疹水疱糜烂、渗液等症状。建议患者遵医嘱使用糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等药物治疗。
4、生殖器疣：好发于生殖器、会阴和肛门部位，主要是由人乳头瘤病毒感染导致，会在阴囊等部位出现针头至绿豆大小的细小丘疹，随病情进展可出现乳头状、鸡冠状、菜花状或团块状的赘生物。建议患者遵医嘱使用氟尿嘧啶乳膏、鬼臼毒素酊等药物治疗，也可进行手术切除，或者冷冻、激光治疗。
5、皮脂腺囊肿：主要是由于阴囊根部的毛囊皮脂腺口堵塞，皮脂腺排泄受阻，而形成皮脂腺囊肿，囊肿生长缓慢，大小体积不等，小的如米粒，大的如鸡蛋。患者可遵医嘱进行手术切除治疗，同时可口服抗生素，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等预防感染。
建议出现该现象的患者在平时生活中避免穿紧身、化纤材质的内裤，同时注意不要搔抓患处，以免刺激症状进一步加重。