通常情况下，软皮鸡蛋可以吃，软皮鸡蛋中的营养成分与普通鸡蛋并无差别，适量吃对身体有益。但避免过量吃，以免引起消化不良，进而不利于身体健康。
软皮鸡蛋属于一种畸形蛋，可能是由于鸡蛋在成型过程中营养物质缺乏，也可能是鸡体内卵壳腺功能异常，壳质分泌不足所致。通常软皮鸡蛋和硬皮鸡蛋中的营养物质相同，均属于营养物质较为丰富的食物，包括蛋白质、微量元素以及矿物质等成分。人群吃软皮鸡蛋后，营养物质可以被人体正常吸收和利用，不会产生有毒物质，对身体无害，因此可以吃软皮鸡蛋。
此外，日常避免过量吃软皮鸡蛋，以免蛋白质摄入过多，加重胃肠道消化负担，出现腹胀、恶心等症状。此外，软皮鸡蛋一般不易保存，在保存过程中若出现蛋皮破损的情况，容易被病原微生物污染发生变质，此种情况下不可以吃。