一般情况下，长期正常使用睡椰棕床垫并不会对人体造成危害，但对某些人群可能有不良影响，常见的为腰背疼痛、降低睡眠质量。同时，还可能诱发皮肤炎症，甚至影响呼吸道健康的情况，部分存在骨骼疾病的人群还可能不利于疾病恢复，必要时可以就医处理。
1、腰背疼痛：椰棕床垫是由椰棕纤维制成的，质地较为坚韧，并且弹性较差。而老年人或日常活动较少的人群，长期睡椰棕床垫可能使得睡眠过程中腰背部肌肉处于紧张状态，可能出现睡醒后腰背部疼痛的情况。
2、降低睡眠质量：椰棕床垫质地较硬，并且睡眠过程中容易受力不均匀，同时长期使用容易发生老化磨损，部分人群长期睡椰棕床垫可能降低睡眠舒适感，从而有降低睡眠质量的风险。
3、诱发皮肤炎症：因椰棕床垫是由天然的椰棕制成，部分皮肤敏感的人群可能对椰棕床垫敏感，则有可能出现皮肤瘙痒、起红疹等皮肤炎症的情况。
4、影响呼吸道健康：椰棕床垫使用时间过长可能释放有害物质，或产生较多的粉尘，有可能刺激上呼吸道感染者、哮喘病等特殊人群的呼吸道，从而影响呼吸道健康。
5、不利于疾病恢复：如果患者存在腰椎 键盘突出症、椎管狭窄等问题，长时间水椰棕床垫过硬，并不利于恢复。虽然对于此类人群建议睡稍硬一些的床垫，但是也应在一定的程度之内，建议选择更符合人体力学的床垫，有利于疾病的恢复。
需注意，虽然椰棕床垫可能对某些人群有不良影响，但对发育期儿童有一定的好处，故而建议根据自身情况选择适宜的床垫。