服用盐酸托莫西汀胶囊，一般不会出现后遗症。后遗症一般是指疾病痊愈或者症状消退后所遗留下来的症状，或者是疾病治疗不恰当所遗留下来的消极影响，并非药物所致，但服用该药物可能会出现胃肠道、神经系统、心血管系统等方面的不良反应。
盐酸托莫西汀胶囊在临床上主要适用于治疗注意缺陷、多动障碍，是非中枢兴奋剂类的药物，在治疗时该药物可选择性抑制大脑内去甲肾上腺素的重摄取，提高前额叶中去甲肾上腺素的浓度，有利于增加注意力，控制注意缺陷及多动障碍。
服用盐酸托莫西汀胶囊后，可能会出现药物不良反应，主要表现在胃肠道不良反应，比如食欲下降、腹痛、恶心、呕吐、消化不良等。另外，还可能会嗜睡、失眠、头晕，以及易生气、兴奋等神经系统症状。还有部分患者会出现心率加快、血压增高或者是体位性低血压等。但是这些不良反应随着治疗时间的延长，多可以逐渐缓解，如果持续出现严重的不良反应，建议及时去医院就医，由医生调整用药方案。
在服用盐酸托莫西汀胶囊期间，严禁自行停药或者减量。除此之外，建议有严重心血管疾病、妊娠期、哺乳期等人群，禁止使用盐酸托莫西汀胶囊，以避免服药后加重原有疾病，影响胎儿或新生儿发育。