杏仁酸本身并不具备祛痘印的效果。杏仁酸属于一种酸性的外用产品，一般用杏仁酸来进行刷酸，可以改善颜面部位的闭合性白头粉刺、开放性黑头粉刺以及红色的炎性丘疹，帮助调整面部肤质，但是对于痘印并没有明确的效果。
所谓的痘印主要是指黑色的色素沉着斑、红色的持久性红斑、凹陷的痘坑和凸起的痘疤，无论是上述四种情况中的哪一种痘印，使用杏仁酸都不会得到很好的治疗。因为杏仁酸既不能够使色素颗粒数量减少，又不能够使血红蛋白数量减少，所以对于色素沉着斑和持久性红斑，不会起到调节作用。除此之外，杏仁酸使用在皮肤表面后，并不能够使皮肤下方的组织再次生长，对于痘坑的效果也不好。对于凸起的痘疤，使用杏仁酸也不会使增生的组织逐渐消退，所以不建议使用杏仁酸来祛痘印。
如果想要祛痘印，可以依据痘印的种类来进行不同的选择。如色素沉着斑可以选择使用氢醌霜，持久性红斑可以选择多磺酸粘多糖乳膏，凹陷的痘坑可以用二氧化碳点阵激光，而凸起的痘疤则可以选择皮肤微晶消磨术。