喝黄芪水头疼可能是体质因素、饮用过多、药不对症等原因引起，建议停止饮用，若头疼持续不能缓解，还需去医院中医科咨询专业医生，在医生的指导下进行调理。
1、体质因素：黄芪味甘，性微温，能补气升阳，若自身属于阴虚火旺、湿热或实热体质，经常喝黄芪水，会使阳热上升至头部，引起口干舌燥、头晕、头疼等上火症状。建议这种体质的人平时少喝或不喝黄芪水，可适当喝一些清热的饮品，如菊花茶、桑叶茶等，改善不适；
2、饮用过多：黄芪性微温，如果一次性饮用黄芪泡的水过多，药性和药效在体内太过，温补的阳气上浮于头部，可能会引起头疼、头昏、面色红晕等症状。建议平时合理饮用，把控好饮用量；
3、药不对症：黄芪属于温补药物，主要具有补气升阳、益卫固表、利水消肿、托毒排脓、敛疮生肌等功效，适用于气虚乏力、表虚自汗、水肿尿少、气血两虚、痈疽难溃等病症。如果自身存在表实邪盛、内有积滞、阴虚阳亢、疮疡初起或溃后热毒尚盛等病症，则不能喝黄芪水，不仅药不对症，还可能加重病情，出现头疼、身体不适等情况。建议在医生指导下对症用药，避免盲目服用药物。