砭灸一般是指两种治疗方法的结合，是砭术和灸法的结合，而艾灸是灸法的主要方式之一，二者所用工具、手法、作用方式均有差别，在使用时多以医生的治疗方案为准。
1、工具：砭灸的工具主要包括砭石和艾柱或艾绒，砭石即能治病的石头，是最早的中医医疗器械之一，其通过打磨过的锋芒尖锐的砭石来进行操作，之后再进行灸法的操作，以艾柱或艾绒为主要操作工具。而艾灸的主要工具如上述为艾柱或艾绒，这两者均由艾草晒干制作而成；
2、手法：砭灸的治疗方法在砭术的部分中有很多应用方法，如刮、擦、刺、按、熨，还可采取放血和开刀排脓。而艾灸的使用手法主要有直接灸、间接灸、悬起灸、实按灸，以及温针灸等；
3、作用方式：砭灸的主要作用方式为直接刺激，通过砭石刺激穴位和局部皮肤，逐渐作用于整体经络来达到治疗目的。而艾灸即便不与皮肤接触，通过燃烧的热力也可将艾草中的阳气传导进入穴位，再经经络循行起到温热的作用。
如需使用砭灸和艾灸治疗疾病，建议在专业医生的指导下进行操作，切勿自行盲目操作，以免造成损伤皮肤等不良后果。