复方枸橼酸阿尔维林软胶囊的副作用，主要是出现荨麻疹、肝脏损害、胃肠道不良症状等，患者要在医生指导下用药，如果出现相关不适症状，要及时去医院就诊。
复方枸橼酸阿尔维林软胶囊主要成分为枸橼酸阿尔维林或者西甲硅油，若对以上两种成分不耐受，可能会出现荨麻疹，有时会伴随咽喉肿痛，严重时会发生休克。由于服药期间血清总胆红素升高，会导致患者会出现肝脏损害，如出现肝功能异常(转氨酶升高)或者药物性肝炎，一般停止服药后会恢复正常。服药过量时可能会出现胃肠道不适，如出现恶心、呕吐等症状，还可能会嗜睡、头晕、虚弱、头痛、口干或者低血压等，一般停药后症状会逐渐缓解。
用复方枸橼酸阿尔维林软胶囊期间，家属要注意观察患者身体状况，一旦感觉到不适要立即停药，同时患者要定期检查肝功能，如果出现转氨酶升高或者药物性肝炎等情况，需要立即停药。另外，对复方枸橼酸阿尔维林软胶囊过敏、麻痹性肠梗阻、前列腺肿瘤患者禁止服用。