早上起来深呼吸胸口疼，可能是胸部外伤、胸膜炎、肺结核、肋软骨炎、冠状动脉粥样硬化性心脏病、心包炎等原因所致，建议就诊于心胸外科或心血管内科，在医生指导下明确病因，予以药物治疗或手术治疗等方式改善症状，避免延误病情。
1、胸部外伤：如果胸部遭到了严重的撞击，可能会使肋间肌或胸肋关节出现损伤，导致局部红肿、疼痛，早上起来深呼吸时胸口随呼吸舒张和收缩，会加重胸口疼的症状。此时应注意休息，在医生指导下予以伤口清创，并使用吲哚美辛片、阿司匹林肠溶片等药物止痛消炎；
2、胸膜炎：如果胸部受到分枝杆菌的感染，由于炎症刺激，会出现充血、红肿、分泌物增多的现象，导致患者早上起来深呼吸胸口疼，并伴有胸闷、咳嗽、哮喘等症状。此时可以遵医嘱使用阿莫西林片、布洛芬缓释胶囊等药物治疗；
3、肺结核：患有肺结核的患者，由于肺部的病灶的位置接近胸膜部位，发生病变时会对胸部产生牵拉疼痛，从而使患者在早上起来深呼吸的时候出现胸口疼的现象，还会伴有咳嗽、咳痰、咳血等症状。此时可在医生指导下服用异烟肼片、利福平胶囊等药物改善症状；
4、肋软骨炎：肋软骨炎是一种肋软骨慢性非特异性炎症，呼吸时会使肋软骨增大，所以出现胸部针刺样的疼痛。建议遵医嘱予以醋酸地塞米松注射液、乙酰氨基酚片等药物缓解疼痛，还可以通过肋软骨切除术等方式治疗；
5、冠状动脉粥样硬化性心脏病：是一种由冠状动脉粥样硬化或狭窄、阻塞引起的心肌缺血、缺氧或心肌坏死的心脏病，早上情绪过于激动，可能会导致急性发作，出现早上起来深呼吸胸口疼的症状。可以遵医嘱使用硝酸甘油片、阿司匹林肠溶片等药物治疗，必要时还需进行经皮冠脉介入治疗；
6、心包炎：多由慢性风湿病转变而来，心肌细胞有不同程度的变性、坏死，可出现明显的胸痛感，可因咳嗽或呼吸而加剧，从而表现为早上起来深呼吸胸口疼。此时需要卧床休息，可在医生的帮助下进行心包穿刺以解除压塞症状。伴有剧烈胸痛、发热时，可遵医嘱使用吲哚美辛肠溶片、盐酸哌替啶注射液等药物。
此外，胃食管反流病、气胸、肺癌等疾病都可能会导致早上起来深呼吸胸口疼。患者在日常生活中应注意休息、避免过度的劳累和提重物、避免剧烈的运动，以免不利于病情的恢复。