怀孕早期脚部CT辐射有多大影响，与CT扫描次数、部位，以及怀孕时间、接触剂量有关。一般怀孕后28天以内，放射线对胎儿的影响是全或无的效应，如有影响会自然流产，如果没有影响，一般可以继续妊娠，如果在怀孕3-8周，属于致畸敏感时期，此时影响比较大。
如果由于疾病的原因，知道怀孕的情况下，在脚部做CT时一般医生会用铅衣进行遮挡，而且需要避开孕妇腹部，对孕妇腹部进行保护，少量次数的CT检查，对胎儿不会产生明显影响。若在不知道怀孕的情况下做脚部CT，偶尔一次对胎儿的影响较小，建议得知怀孕后做好产前检查，同时在怀孕14-19周做唐氏筛查，在怀孕22-26周时，做排畸超声检查，确定是否存在畸形情况，并根据检测结果决定后续处理。
孕妇在怀孕期间，应尽量避免做CT检查，尤其在孕早期，容易影响胚胎发育，因此能不做尽量不要做CT检查，同时要定期检查胎儿发育情况。