艾灸后有褐色分泌物没有具体的时间表明多久能干净，因为每个患者的体质不同，症状也不同。据临床经验所得，一般非疾病导致可在3-5天干净，如果是妇科疾病导致可能需要15天左右干净。
1、残留经血排出：艾灸后有褐色分泌物可能是因之前经血排出不畅，在艾灸后少量经血排出，但因其长期堆积在体内，被氧化后颜色就可能会变得比较深或者出现褐色，表现为褐色分泌物。这种情况属于正常现象，艾灸具有活血的功效，可以帮助人体将体内的陈年污垢瘀血排出体外，这些污垢被排出体外后，可以缓解月经不调的现象；
2、妇科疾病：部分患者出现褐色分泌物也可能是由宫颈炎、子宫内膜息肉等妇科疾病引起，通常还会伴随腹痛、性交痛等症状。当发现这些症状后，应立即停止艾灸，然后完善阴道镜等检查后明确原因并进行治疗，可遵医嘱使用头孢克肟胶囊、阿奇霉素分散片等药物。
当出现褐色分泌物后，一定注意保持局部清洁，避免出现感染的现象，也要及时观察。在进行艾灸的过程中一定要注意清淡饮食，避免辛辣刺激性食物，可以多喝热水帮助身体排毒。