13价肺炎疫苗，即13价肺炎球菌多糖结合疫苗，适合3周到15个月的婴幼儿接种，通常在2、4、6个月时进行3次基础免疫。首剂最早在6周时接种，之后每剂接种间隔4-8周，在12-15个月时进行一剂加强免疫，能在体内产生持久的保护性抗体，通常能维持2年以上。年龄较小的婴儿推荐接种部位为大腿前侧，幼儿的接种部位为上臂三角肌。若2岁以上的人群未接种13价肺炎球菌多糖结合疫苗，可以接种23价肺炎球菌多糖结合疫苗。
13价肺炎球菌多糖结合疫苗可以预防13种肺炎球菌血清型引起的肺炎球菌性疾病，如脑膜炎、肺炎、鼻窦炎，但不能预防疫苗效果以外的血清型别，以及其它微生物所导致的疾病。此外对疫苗中的活性成分、白喉类毒素过敏的人群应禁止接种，患有其它急性、严重发热性疾病的人群应延缓接种。
接种后应在医院观察30分钟后才可以离开，观察是否发生不良反应。常见的不良反应包括发热、嗜睡、腹泻、皮疹，以及接种部位硬结、红肿、疼痛，甚至会出现荨麻疹、热性惊厥、支气管痉挛、呼吸困难等严重不良反应，但通常比较少见。