复合果汁在适量饮用的情况下，并不会产生副作用，但是饮用量比较多时，就有可能会产生副作用，如出现身体肥胖、血糖升高、急性胃肠炎等。
1、身体肥胖：复合果汁是由多种水果制作而成，是多种水果压榨成的果汁。其糖含量比较高，在长时间以及大量饮用的情况下，且没有进行运动消耗，这些糖分就会转化为热量和脂肪堆积在身体各处，导致身体处于比较肥胖的状态；
2、血糖升高：复合果汁由于糖含量比较高，过量摄入后，就有可能会影响到血糖的控制，也可能会造成血糖升高。对于高血糖以及糖尿病人群，应尽量避免喝过多的复合果汁，其不利于血糖的控制，以免对身体健康造成影响；
3、急性胃肠炎：复合果汁属于一种凉性的饮料，尽量避免喝过多，尤其是冬季，如果过量饮用有可能会加重胃肠道的负担，导致急性胃肠炎发作，使得机体出现腹胀、腹痛、恶心、呕吐等不良症状，影响机体健康。