CT结果是结肠癌，但肠镜查不到，可能是在进行检查时肿瘤很小，在进行结肠镜检查时漏诊或忽略肿瘤导致，也有可能是结肠癌没有向肠腔内生长导致，建议再次进行肠镜检查或者是进行病理活检。
如果患有结肠癌，在进行CT检查时可能会显示出结肠癌病灶，发现肠腔内肿块或肠壁局限性或者环形增厚，在进行肠镜检查时能够清晰地显示出结肠癌的位置、大小以及浸润程度。如果CT结果是结肠癌，但肠镜查不到，可能是结肠癌肿瘤的体积较小，被遗漏导致。另外，如果结肠癌病灶没有向肠腔内生长，反而沿着肠内壁直接向外生长，此时肠镜检查可以看到肠腔内壁正常，也有可能导致CT结果是结肠癌，但肠镜查不到。因此，如果CT显示肠癌，但结肠镜检查显示正常，则有必要进行第二次肠镜检查，部分结肠癌患者需要多次进行肠镜检查才能发现肿瘤，必要时可能需要切除病灶组织直接送病理检查，确认是否为结肠癌。
肠镜检查可以初步筛查结肠癌，并确定病变的位置和大小，但是不能完全确诊为结肠癌，还需要通过抽血检查、病理组织活检、增强CT等检查进行确认。如果确诊为结肠癌，需要尽早进行手术切除，此外结肠癌患者在治疗阶段还应定期进行肠镜检查，一般3-6个月复查一次，以了解治疗情况，防止复发。