怀孕吃鱼油最佳的时期是在怀孕中晚期，即怀孕5-6个月以及怀孕7-9个月的时候，都可以适当增加鱼油的摄入。怀孕中晚期是胎儿生长比较快速的阶段，会需要更多的蛋白质、碳水化合物、脂肪、维生素、矿物质等，鱼油可以较好的补充DHA(二十二碳六烯酸)、亚麻酸等营养元素，是胎儿生长发育必不可少的营养物质。
怀孕吃鱼油能够促进视网膜光感细胞成熟，促进胎儿大脑发育，对胎儿的视神经、脑神经发育可以起到良好的促进效果。所以，一般建议在怀孕4-5个月时可以开始补充鱼油，此时为胎儿生长发育最为快速的阶段，在补鱼油的同时也可以适当补充钙剂，可以预防孕妇缺钙以及促进胎儿的发育生长。
孕妇补充鱼油的时间和剂量最好咨询医生，根据医生的建议进行适当补充。鱼油中含有大量的不饱和脂肪酸，若摄入过多可能会阻碍其他营养物质吸收，故不建议补充过多。对鱼或海鲜过敏者在服用鱼油时，也可能会出现过敏症状，因此这类人群应谨慎选择。