正常成年人阴茎呈下垂状，其自然长度4.1-12cm，平均5cm，若男人阴茎短可能是正常生理现象，也可能是由于遗传因素、先天性睾丸发育不全、肥胖、雄激素缺乏等原因导致。
1、生理现象：由于年龄较小，阴茎还没有完全发育，此时阴茎短则属于正常现象，当阴茎逐渐开始发育后便会达到正常水平，无需担心。
2、遗传因素：如果亲属的阴茎较为短小，可能会遗传，使后代出现阴茎短小的现象，如果影响性生活，可以进行阴茎延长术治疗。
3、先天性睾丸发育不全：主要是由于染色体异常导致的，此类患者的外生殖器常呈正常男性样，但阴茎较正常男性短小，一般需按医生要求应用十一酸睾酮软胶囊、复方八维甲睾酮胶囊等治疗。
4、肥胖：如果身体过度肥胖，可能会导致会阴部位脂肪堆积，使阴茎部位被包裹，显得阴茎较为短小，但其实际长度未变，通过积极运动、控制饮食减肥后便会得到改善，如多跑步、游泳等。
5、雄激素缺乏：如果在青春期时，自身雄激素分泌不足，可能会导致阴茎发育不良，呈现出阴茎较正常同龄人短小的现象，此时可以遵医嘱应用十一酸睾酮软胶囊、十一酸睾酮注射液等药物治疗。
此外，睾丸炎、附睾炎、生殖器畸形等疾病也可能会导致男性阴茎短，若影响正常性生活，则建议及时到医院男科就诊明确具体原因，然后积极治疗。