妇科菌群失调，通常是指女性阴道菌群失调，大多见于机体抵抗力下降、生理期、糖尿病的女性，此时由于阴道内环境改变，可能会出现菌群失调。女性阴道菌群失调，可以通过一些食物进行调理，也可在医生的建议下通过药物进行调理。
如果菌群失调情况较轻，可以在生活中多食用一些含蛋白质、维生素等营养成分较高的食物，如奶类、肉类、蛋类，以及其他新鲜的水果、蔬菜等，增强体质，提高机体自身调节能力，帮助菌群恢复正常。如果患有糖尿病的患者，建议在日常生活中控制糖分的摄入，可以吃一些无糖、少糖的食物。控制住血糖后，对菌群失调的恢复有一定帮助。
如果菌群失调情况较重，可以遵医嘱口服抗厌氧菌药物，如甲硝唑、替硝唑、克林霉素等进行调理。情况较严重时，可遵医嘱外用含乳杆菌的药物，如阴道用乳杆菌活菌胶囊，或甲硝唑栓剂进行治疗。