色素痣按着有点疼可能是由外界刺激、色素痣继发炎症、色素痣外伤等因素引起的，建议患者在出现症状后不要频繁触摸患处，以免症状加重。
1、外界刺激：若色素痣的位置比较暴露，且近期经历过暴晒、寒冷刺激等，外界刺激可能会导致色素痣内部出现反应，进而导致患者出现疼痛感。还会根据诱因出现伴随症状，比如皮肤晒伤、明显寒冷感等，一般在去除诱因后，症状可得到缓解；
2、色素痣继发炎症：可能是由抵抗力降低等因素引起，当色素痣被细菌等病原体感染后，色素痣内部的炎症刺激可能会导致患者出现疼痛感，还会伴随红肿等症状。可遵医嘱使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物治疗；
3、色素痣外伤：当色素痣被外力撞击或被利器划伤后，内部可能会出现淤血或是表皮破溃，此时局部组织会出现水肿，进而出现疼痛症状，还会伴随出血等症状。应及时使用碘伏等消毒液进行清创，然后根据伤口大小选择处理方式，若伤口较小可使用创口贴，若伤口较大则需要遵医嘱缝合处理。
此外，若色素痣出现癌变，则也有可能会出现疼痛感，还会伴随破溃、出血等症状，可到医院皮肤科等科室就诊，完善皮肤视诊等检查后遵医嘱进行治疗即可。