百日咳合并肺炎要警惕的疾病较多，主要为支气管肺炎、肺不张、结核病恶化，还需谨慎考虑腹外疝、百日咳脑病，建议挂呼吸内科，并配合医生治疗。
1、支气管肺炎：支气管肺炎是百日咳婴幼儿常见的并发症，以间质性肺炎相对多见，主要源于细菌感染，表现为呼吸困难、发绀，以及肺部湿啰音增多。严重情况下，可能引发肺气肿、肺不张等。建议保持呼吸道通畅，给予吸氧治疗和解痉排痰治疗，遵医嘱给予红霉素分散片、罗红霉素分散片等抗生素治疗。
2、肺不张：由于患上支气管炎或者支气管被黏稠的分泌物堵塞所致，出现肺不张现象时，可能给患者的身体造成严重的伤害。建议采取体位的引流吸痰、肺部理疗，必要时用支气管镜，排出局部阻塞的分泌物。
3、结核病恶化：百日咳可能导致已经存在的结核病情恶化，甚至诱发结核病的血行播散。对于结核病恶化，需要积极进行抗结核治疗，可选择异烟肼片、吡嗪酰胺片等抗结核药物。
4、腹外疝：百日咳可引起剧烈咳嗽，可能导致脏器脱出腹腔，建议积极治疗原发病，并予以复位治疗。
5、百日咳脑病：是百日咳疾病危重的并发症，可能出现 脑缺氧和脑出血的现象，情况紧急。发生百日咳脑病后，必须立即送往医院救治，需控制脑水肿、改善脑循环。
在出现百日咳后，应注意关注孩子的情况，并定期进行检查，以确定病情，避免耽误治疗。