菌丝阳性通常指身体的某个部位感染了真菌，多数情况下见于真菌性皮肤病，或者其他疾病继发真菌感染，属于真菌检查的结果，如真菌直接镜检。此外，真菌的基本形态是孢子和菌丝，多通过接触、摄入、吸入等引起感染。可以根据具体情况使用外用或者口服的抗真菌药物，比如氟康唑、制霉菌素、环吡酮胺、伊曲康唑以及特比萘芬等。
对于菌丝阳性患者而言，如果感染真菌的部位在头部，引发的疾病称为头癣，在手掌部则可引发手癣，而菌丝阳性还可发生于腹股沟、足部等部位，可引起股癣、足癣等疾病。菌丝阳性也可能见于甲真菌病、股癣等，应对症进行治疗。而如果是其他疾病继发真菌感染，则应积极治疗原发病，之后针对真菌感染进行治疗。
如果是女性，检查阴道分泌物会出现假菌丝阳性，也属于真菌感染，多见于外阴阴道念珠菌病，治疗可使用口服的抗真菌药和外用抗真菌栓剂。
而在菌丝阳性患者治疗期间，应保持个人皮肤卫生、穿着宽松的衣物，并且避免用力抓挠、按摩患处皮肤，以免出现皮肤破溃而引发感染。另外，患者还应做好个人隔离和使用物品的消毒，尽量避免与家人共用毛巾、指甲刀等，以免传染真菌。