二妙丸、三妙丸、四妙丸的药物组成不同，从而导致三者的功效不同、性状不同、作用不同，患者服用时应在医生指导下选择对症的药物进行治疗。
1、组成不同：二妙丸由炒苍术、炒黄柏两种中药材制作而成。三妙丸由炒苍术、炒黄柏、牛膝三种中药材制作而成。四妙丸由盐黄柏、牛膝、苍术、薏苡仁等四种中药材制作而成；
2、功效不同：二妙丸和三妙丸都具有燥湿清热的功效，四妙丸具有清热利湿的功效；
3、性状不同：二妙丸为黄棕色的球形或类球形水丸，三妙丸为灰黄色的水丸，四妙丸为浅黄色至黄褐色的水丸；
4、作用不同：二妙丸通常用于治疗湿热下注引起的阴囊潮湿、白带、等症。三妙丸通常用于治疗湿热下注引起的下肢沉重、小便黄少、足膝红肿热痛等症状。四妙丸通常用于治疗湿热下注引起的足膝红肿、筋骨疼痛等症状。
患者在服用上述药物的时候还需要注意戒烟酒，避免吃辛辣、油腻的食物，以免影响药物的疗效，并且需要在医生指导下按时按量服用，不可以自己盲目用药。