牙垢检测幽门螺杆菌不一定准确，一般可以作为辅助参考。幽门螺杆菌感染是胃炎、胃溃疡甚至胃部肿瘤发病的重要因素，牙垢检测出幽门螺杆菌并不能说明胃部被幽门螺杆菌感染。所以根据牙垢检测出幽门螺杆菌后，盲目采取治疗属于不科学的做法。
若牙垢检测出幽门螺杆菌，只是说明牙垢中存在幽门螺杆菌感染，由于食物通过口腔进入胃部，提示胃部存在一定感染幽门螺杆菌的风险，但并不能说明胃部已经感染幽门螺杆菌，还需要进行其他检查确诊。幽门螺杆菌的检查通常根据C13或C14呼气试验、血清抗体检测、快速尿激酶检测或者组织学检测等明确。
此外，市面出现其他自我检测幽门螺杆菌的方法，包括口腔试纸或者试剂等，可能受到诸多影响出现假阳性或假阴性，如果有消化道症状，建议至正规医院消化内科就诊，进行科学检查及治疗，以免自测出现漏诊或误诊。