基底动脉开窗畸形若无临床症状时，一般不需要干预治疗，若伴有严重头晕、剧烈恶心、言语不清等症状时，可遵医嘱通过药物治疗或手术治疗改善，防止病情恶化。
1、无需治疗：基底动脉开窗畸形是一种先天性的大脑血管发育异常，症状较轻时可能有轻微头晕、恶心等表现，但无其他严重不适症状时，可遵医嘱定期进行颈动脉超声检测，及时观察局部变化即可，无需特殊治疗；
2、药物治疗：若基底动脉开窗畸形较严重，可能造成后循环异常，也就是大脑后部的基底动脉椎动脉的血流动力学改变，出现反复脑缺血，甚至出现脑梗，主要表现为明显的头晕目眩、恶心、呛咳或肢体无力、口角歪斜、吐字不清等症状。这种情况下可遵医嘱使用扩张血管的药物，如硝酸甘油片、尼可地尔片、注射用硝普钠等，进行保守治疗，改善由于基底动脉造成的血流异常，从而使症状缓解；
3、手术治疗：若保守治疗效果不佳时，也可通过动脉搭桥术、支架植入术、血管重塑术等手术治疗，帮助局部进行血液循环，避免堵塞。
治疗过程中还需注意严格控制血压、血脂、血糖，保持低盐、低脂的饮食习惯，避免吸 烟、饮酒等不良习惯，坚持健康饮食，健康作息，有助于疾病恢复。