两岁宝宝发烧拉肚子在临床上较为常见，既可能是由细菌性胃肠炎、病毒性胃肠炎所导致，也可见于急腹症等情况。一般建议家长及时带宝宝进行血常规、大便常规以及影像学检查，以明确具体原因。
1、细菌性胃肠炎：细菌感染可以引起胃肠道炎症，常见于细菌性肠炎或细菌性痢疾，细菌感染可以破坏宝宝肠道内的菌群环境，并对肠黏膜造成刺激，而加快肠道蠕动，还可能影响体温调定点，可能出现两岁宝宝发烧拉肚子。而除上述症状外，宝宝可能会出现黏液脓血便，此时家长可以将宝宝的大便及时收集并送到医院进行化验；
2、病毒性胃肠炎：如果存在轮状病毒性肠炎或诺如病毒急性胃肠炎，宝宝的胃肠道功能可能出现异常，且存在病毒感染，同样可以两岁宝宝发烧拉肚子，并且可能会伴有不同程度的呕吐，严重的宝宝还会伴有脱水、水电解质酸碱平衡紊乱。而胃肠型感冒也由于病毒感染引起，可造成胃肠道功能紊乱，并出现此类情况，还可能伴有呼吸道感染症状，如打喷嚏、流鼻涕、鼻塞、咳嗽等；
3、急腹症：宝宝发生阑尾炎等外科急腹症时，可能因炎症感染而出现发烧，也可能因炎症刺激导致肠蠕动加快而表现为拉肚子，导致两岁宝宝发烧拉肚子，同时宝宝还可能出现进行性加重的腹痛等症状。此时家长需要及时带宝宝到医院进行腹部超声，查看阑尾是否有增粗，或阑尾局部是否明显炎性渗出等，从而明确诊断；
4、其他原因：如果由于饮食不洁，比如吃了变质的食物，或者在晚上睡觉并未妥善保暖，存在受凉等情况，均可能导致两岁宝宝发烧拉肚子。家长要注意给宝宝提供健康、营养的食物，并且注意宝宝的保暖，以免出现此类情况。
如果两岁宝宝发烧拉肚子需要严格控制饮食，并且宝宝可在医生指导下口服藿香正气软胶囊或藿香正气滴丸等药物进行治疗，还可以口服枯草杆菌二联活菌颗粒等以改善肠道功能。而如果确诊为急性阑尾炎，则需要及时进行外科手术治疗。